由于此前2006年德国世界杯预选赛第三轮在6月9日结束，国足主教练阿里汉在备战亚洲杯的第一次集训中征召了世界杯预选赛前三轮中的绝大多数队员，6月21日备战此次亚洲杯30名国脚进行了首次集训，祁宏，于根伟，陶伟，郝伟等名将因伤落选，此后张玉宁，王亮，徐亮，安琦落选26人大名单，7月9日国足公布参加此次亚洲杯的最终23人大名单，肖战波，王鹏，刘金东成为最后的落选者离开香河基地，此次名单值得注意的是大连实德老将李明回归国家队，85年的山东鲁能小将周海滨和天津泰达前锋张烁进入最终名单。
7月17日小组赛首场比赛在北京工体打响，刘云飞首发门将，李玮锋和郑智搭档中后卫，周挺和魏新镇守左右边路，李霄鹏和周海滨坐镇中场，阎嵩和队长肇俊哲担任左右边前卫，李金羽和队友出任双前锋，第30分钟中场核心李霄鹏受伤下场，刚刚伤愈的邵佳一替补出场，第40分钟巴林前锋胡贝尔面对出击的刘云飞挑射破门，下半场阎嵩带球突入禁区获得点球机会，郑智在第一次主罚被判无效的情况下冷静罚出勺子点球扳平比分，第66分钟周挺送出直传助攻，李金羽前插后推射破门反超比分，此后孙继海替换邵佳一上场，李毅替换队友出场，第89分钟巴林队禁区前沿远射扳平比分，东道主中国队出师不利首场即被业余球员组成的巴林2:2逼平。
7月21日小组赛第二场对阵印尼，首场比赛后备受质疑的阿里汉选择变阵，孙祥首次代表国家队出战，与国奥队友阎嵩组成左路搭档，李明首发右前卫，肇俊哲回到中路担任后腰，邵佳一首发前腰，开场后中国队优势明显，第25分钟李金羽助攻邵佳一得分，上半场结束前邵佳一助攻队友得分，下半场开始李毅替换受伤的队友出场，第52分钟李明主罚角球直接破门得分，第65分钟邵佳一禁区内推射破门，此后郑斌替换邵佳一出场，第80分钟李毅接阎嵩助攻头球破门将比分锁定为5:0，梅开二度的邵佳一获得全场最佳球员，值得注意的是英超曼城主力孙继海继续替补没能获得出场机会，这也让他的父亲和媒体及球迷对阿里汉的强烈不满。
7月25日小组赛第三场对阵卡塔尔，本场比赛阿里汉用北京国安球员徐云龙顶替魏新首发右后卫，李毅首发与李金羽搭档锋线，开场后中国队虽占据优势但久攻不下，卡塔尔也在几次反击中觅得机会，但双方均未能破门得分，第55分钟郑斌替换阎嵩出场，第68分钟张耀坤和孙继海分别替换邵佳一和李金羽登场，用两名防守队员换下进攻球员，中国队想保住一分，第78分钟李明开出角球李玮锋后点头球摆渡，徐云龙门前跟进头球得分，最终中国队1:0战胜对手，小组赛结束后中国队以2胜1平积7分获得小组第一顺利出线。
7月30日四分之一决赛对阵伊拉克，此战前国足多人遭受伤病问题，李玮锋和邵佳一都是有伤在身出场，开场仅仅7分钟李明右路长传助攻队友破门，比赛中对手多次采用犯规手段阻止中国队进攻，李玮锋更是遭到对手多次暗算，第25分钟右后卫魏新受伤离场，徐云龙替补出场，下半场伊拉克队开始疯狂反击，制造多次威胁，阿里汉及时换人变阵451，孙继海替换队友上场担任前腰，第80分钟邵佳一突入禁区被铲倒获得点球，郑智一蹴而就，补时阶段伊拉克门将禁区内故意击打孙继海被红牌罚下并判罚点球，郑智再次打进梅开二度，最终国足3:0战胜对手进入四强，郑智被评为全场最佳球员。
8月3日半决赛对阵伊朗，伊朗队可谓是中国队宿敌，历史交锋上多次战胜国足，中国队张耀坤首发出场，郑斌代替阎嵩首发左前卫，伊朗队阿里代伊，马达维基亚，卡里米，内科南等大将悉数登场，第18分钟邵佳一插上接队友回传推射为国足先拔头筹，第37分钟伊朗扳平比分，双方以1:1结束上半场，下半场第54分钟对方球员对邵佳一恶意犯规被红牌罚下，此后中国队依靠人数优势多次威胁对方球门，其中李金羽妙传孙继海一次门前近在咫尺的射门未进非常遗憾，加时赛中孙祥的射门还曾击中门柱，最终双方1:1进入点球大战。
在惊心动魄的点球大战中前三轮郑智，李霄鹏主罚命中，第二个出场的肇俊哲点球击中立柱，而伊朗队阿里代伊，马达维基亚，内科南全部命中，第四轮孙祥抵住压力将球罚进，伊朗队莫巴利主罚击中横梁，双方点球打成3:3，最后一轮邵佳一轻松打进，而伊朗队最后出场的老将哈马迪的勺子点球被刘云飞扑出，中国队以总比分5:4杀入决赛，决赛将面对日本队，而中国队的后防大将李玮锋原本就因为滑囊炎坚持作战，与伊朗的比赛中他又被撞断2根肋骨却顽强的坚持到比赛结束，作为后防核心的他也将缺席最后的决赛。
8月7日第13届亚洲杯决赛中国队对日本队在北京工人体育场打响，中国队李玮锋因伤缺阵，据说日本队当时得知此消息曾在更衣室振臂高呼，张耀坤顶替李玮锋出场，而在1/4决赛对约旦比赛中上演点球换球门事件勉强晋级的日本队由中村俊辅领衔，开场不久李金羽获得门前良机将球顶高，此后日本队利于任意球机会由福西崇史头球破门，第31分钟阎嵩在左路带球突破后横传门前，李明倒地射门扳平比分，下半场第66分钟日本队中村俊辅主罚角球，中田浩二在后点用手将球打进，主裁判无视中国队的抗议判罚进球有效，中国队1:2落后。
此后中国队大举进攻，第78分钟替补上场的李毅获得单刀，他带球试图过掉门将时被扑出浪费了绝佳良机，比赛结束前日本队趁国足大举进攻时打出反击由玉田圭司单刀破门，将比分锁定3:1获得亚洲杯冠军，而中国队在本土举办的亚洲杯决赛中遗憾的屈居亚军，这样的结果也让中国队上下非常郁闷，主教练阿里汉甚至拒绝上台领奖，而时任亚足联主席的哈曼时候也承认那确实是一个手球，多年后当时的日本队员也曾对媒体表示那是一个聪明的上帝之手。最后郑智，邵佳一，肇俊哲三人入选亚洲杯最佳阵容，而亚足联居然还颁发给中国队一个公平竞赛奖，实在是令人哭笑不得。
2004年亚洲杯中国队球员大名单：
门将：1刘云飞，23李健，30孙寿博
后卫：14李玮锋，5郑智，4张耀坤，16季铭义，3孙祥，13徐云龙，7孙继海，12魏新，27周挺
中场：21李明，15肇俊哲，18李霄鹏，8郑斌，6邵佳一，25周海滨，22阎嵩
前锋：29李金羽，11李毅，19张烁
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